Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms