Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D9H8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D9H8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D9H8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9D9H8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9D9H8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9D9H8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9D9H8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9D9H8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D9H8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms