Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmd12Q9D8W5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmd12Q9D8W5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmd12Q9D8W5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms