Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D8Q6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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