Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Derl3Q9D8K3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Derl3Q9D8K3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms