Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms