Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl4Q9D8E6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms