Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp5Q9D7S9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp5Q9D7S9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms