Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PudpQ9D5U5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms