Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4f1Q9D5Q6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms