Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc7Q9D541 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc7Q9D541 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc7Q9D541 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms