Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fam227bQ9D518 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam227bQ9D518 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms