Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmntd1Q9D4C1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms