Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2lQ9D478 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2lQ9D478 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms