Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933425L06RikQ9D3Z8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933425L06RikQ9D3Z8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms