Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpn3Q9D3W4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpn3Q9D3W4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms