Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt20Q9D312 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt20Q9D312 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms