Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl28Q9D1B9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl28Q9D1B9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms