Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm12Q9D0R8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms