Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR3

Tomm40l, Mitochondrial import receptor subunit TOM40B, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40lQ9CZR3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tomm40lQ9CZR3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tomm40lQ9CZR3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms