Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
3100002H09RikQ9CXW6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms