Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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SdhdQ9CXV1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SdhdQ9CXV1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SdhdQ9CXV1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdhdQ9CXV1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdhdQ9CXV1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdhdQ9CXV1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdhdQ9CXV1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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