Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nip7Q9CXK8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms