Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms