Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RpainQ9CWY9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms