Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx28Q9CWT6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx28Q9CWT6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms