Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx10Q9CWT3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms