Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn1Q9CWM4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn1Q9CWM4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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