Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms