Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CRC3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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