Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ska2Q9CR46 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms