Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr3kQ9CQZ7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms