Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms