Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms