Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trappc2Q9CQP2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trappc2Q9CQP2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trappc2Q9CQP2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trappc2Q9CQP2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trappc2Q9CQP2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trappc2Q9CQP2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trappc2Q9CQP2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trappc2Q9CQP2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms