Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl35Q9CQL6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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