Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms