Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms