Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms