Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
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