Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms