Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms