Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms