Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms