Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mccc1Q99MR8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mccc1Q99MR8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms