Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PccbQ99MN9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms