Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp5lQ99LH9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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