Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms