Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcf2Q99LE6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms