Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pagr1aQ99L02 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms